El biogás se genera sólo en ausencia de oxígeno, al degradarse la materia orgánica. El proceso de degradación de la materia orgánica se inicia cuando se disocian las macromoléculas que la componen, hasta llegar a ser componentes elementales (principalmente ácidos).  Estos componentes elementales se combinan para formar metano, dióxido de carbono, trazas de hidrógeno y de sulfuro de hidrógeno.

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